研究人员鉴定了数百种影响肿瘤基因表达的编码基因之外的突变

2022-05-22 / 作者:猫咪资讯 / 来源:网络整理 / 阅读:859 /
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科学家首次将位于编码基因之外的突变与肿瘤基因表达的变化联系起来,帮助开发未来的诊断和治疗策略。Zhang等人利用测序数据库鉴定了编码基因之外的数百个DNA序列突变,为治疗癌症的新治疗途径铺平了道路。影像学分:张等,doi:10.1038/s 14588-018-0091-2。癌症......

科学家首次将位于编码基因之外的突变与肿瘤基因表达的变化联系起来,帮助开发未来的诊断和治疗策略。

Zhang et al utilized sequencing databases to identify hundreds of mutations in DNA sequences outside of coding genes, paving the way for novel therapeutic avenues to treat cancer. Image Credit: Zhang et al, doi: 10.1038/s41588-018-0091-2.

Zhang等人利用测序数据库鉴定了编码基因之外的数百个DNA序列突变,为治疗癌症的新治疗途径铺平了道路。影像学分:张等,doi:10.1038/s 14588-018-0091-2。

癌症是由于不受控制的细胞生长和分裂而发展起来的,最终导致癌细胞在全身的转移扩散,引起大量器官功能障碍。

开创性的研究表明,转化为癌细胞是由细胞基因突变的积累驱动的。

研究人员阐明了基因内特定突变的影响,并发现这些突变在癌症的特征中起着不可或缺的作用。这项研究导致了许多成功的治疗方法在今天的临床上的发展。

然而,在癌细胞中发现的绝大多数突变是在基因之外的脱氧核糖核酸序列中发现的,称为非编码区。这些突变对审问有更强的抵抗力。

加州大学圣地亚哥分校的研究人员发现了数百个非编码区的突变,这些突变直接调控着癌症相关基因的表达。他们的工作发表在《自然遗传学》杂志上。

“大多数与癌症相关的突变发生在基因之外的基因组区域,但它们的数量多得令人难以置信,以至于很难知道哪些是真正相关的,哪些仅仅是噪音,”资深作者、穆雷斯癌症中心和加州大学圣地亚哥分校医学院的教授特雷·伊德克博士说。

一些试图理解非编码突变影响的尝试已经使用了癌症基因组图谱(TCGA),一个由国家卫生研究院建立的正常组织和肿瘤基因组测序数据的储存库。然而,这些努力只发现了一个相关的非编码突变。

Ideker和他的合作者在其他人做不到的地方取得了成功,他们在利用TCGA数据的同时增加了一层额外的分析。

“秘密酱料是寻找基因表达的变化,”Ideker说。

“在这里,我们首次在非编码DNA中发现了约200种在癌症中起作用的突变& # 8212;这比我们之前知道的要多199个,”他补充道。

该团队通过模拟癌细胞系中这些功能性非编码突变的影响来验证他们的发现。

他们发现这些突变直接影响了驱动癌症特征的基因表达,包括肿瘤细胞侵袭。

“一个突出的例子是影响一个名为DAAM1的基因的非编码突变,”第一作者张巍 博士说,他是Ideker实验室的博士后研究员。

“DAAM1的激活使肿瘤细胞更具攻击性,更能侵入周围组织。”

他们的工作可能有助于开发新的诊断和治疗策略,这些策略依赖于识别患者肿瘤中的功能突变。

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张巍 等,一个连接非编码突变和肿瘤基因表达变化的全球转录网络。《自然遗传学》,2018年4月2日在线发表;doi:10.1038/s 14588-018-0091-2


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