中国黄芩基因组测序

2022-02-24 / 作者:猫咪资讯 / 来源:网络整理 / 阅读:744 /
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来自约翰·英尼斯中心和中国科学院的一组遗传学家已经为中国黄芩(黄芩)产生了第一个高质量的基因组序列,黄芩是50种传统中药之一。中国黄芩(黄芩)。影像学分:Andrey Korzun / CC BY-SA 3.0。半枝莲是薄荷科的一种开花植物,在中国、朝鲜、蒙古和西伯利亚都有发现。......

来自约翰·英尼斯中心和中国科学院的一组遗传学家已经为中国黄芩(黄芩)产生了第一个高质量的基因组序列,黄芩是50种传统中药之一。

The Chinese skullcap (Scutellaria baicalensis). Image credit: Andrey Korzun / CC BY-SA 3.0.

中国黄芩(黄芩)。影像学分:Andrey Korzun / CC BY-SA 3.0。

半枝莲是薄荷科的一种开花植物,在中国、朝鲜、蒙古和西伯利亚都有发现。

这种植物也被称为黄芩,化学成分非常复杂,富含黄酮类抗氧化剂(如汉黄芩素和黄芩苷)。

黄芩在中药中很重要,其干燥的根制剂“秦煌”用于治疗许多疾病:腹泻、痢疾、高血压、出血、失眠、炎症和呼吸道感染。这种植物的提取物可以杀死肝癌和白血病细胞,但是缺乏人体数据。

尽管对这种植物的商业兴趣和需求不断增加,但由于缺乏基因组信息,通过育种进行的改良受到了限制。

该研究的资深作者、约翰·英尼斯中心的Cathie Martin教授说:“这种植物在根部制造生物活性化合物,这意味着你必须等待三年,植物才能长得足够大,当然在生根时,你会破坏植物。

“我们筛选了薄荷家族中一些在叶子中制造类似化合物的成员,这意味着你可以用不同的方式获得更可持续的治疗方法。”

马丁教授和他的同事从中国上海陈山植物园的一株植物中提取了脱氧核糖核酸,并结合测序策略,将93%的基因组组装成9个假染色体。

将序列与近缘物种芝麻和一串红的序列进行比较,揭示了黄芩属中合成生物活性化合物的专门代谢途径是如何进化的。

“当我们开始对基因组序列进行分析时,这就像一个启示& # 8212;它从根本上展示了获得有价值化合物的途径是如何进化的,”马丁教授说。

“序列非常好,可以提高对薄荷家族所有其他基因组序列的理解。这是一个在传统中药和调味品中非常重要的植物大家族。”

研究结果发表在《分子植物》杂志上。

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赵卿等人的黄芩参考基因组序列提供了汉黄芩素生物合成进化的见解。分子植物,2019年4月14日在线发布;doi: 10.1016/j.molp.2019.04.002


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